医药活性炭具有这些特点，在脱色方面的速度快，吸附能力强，内孔隙结构发达，孔隙粗大等特点。可用于抗生素、维生素、辅酶A、解热药、磺胺药、抗结核病药、生物碱、激素注射液等药物的脱色与精制。

医药活性炭可用于消化系统疾病的治疗。李时珍在《本草纲目》中记载道：用果核烧炭来治疗腹泻和胃病。其主要的作用是消除细菌毒素。将细菌或使病毒吸附到孔隙中，这不仅是一种吸附的现象，还是一种机械和生物性质的过程。

医药活性炭还可用于解毒。例如由蘑菇、变质的食品、生物碱、各种金属、酚、磷等引起的中毒，当毒性还不确定时，它作为一种比较普遍而有效的解毒剂是任何药品也不能替代的。